虎門醫院是一所集醫療、教學、科研、預防保健、康復為一體的綜合性二級甲等醫院，是廣東省高等醫學院校教學醫院和東莞市社保定點醫院。現占地面積12.3萬平方米，總建筑面積5.8萬平方米，設有醫院總部、樹田分院、盧屋門診部三大部分。醫院職工677人，其中高級職稱43人，中級88人。定編床位362張。
虎門醫院本部：設有內、外、婦、兒、口腔、五官、中醫科等門診、急診診室；設有兒科、心血管內科、普通內科、普通外科、泌尿外科、婦產科等住院科室；設有麻醉手術科、檢驗科、放射科（含CT）、超聲、心電圖、內鏡等醫技檢查科室。
虎門醫院樹田分院：設有內、外、婦、兒等門診，急診診室；設有綜合內科（血透室）、腦科、ICU、骨外科、手外科、康復醫學科等住院科室；設有麻醉手術科、介入治療科、高壓氧室、檢驗科、放射科（含磁共振、CT）、B超、心電圖、腦電圖、肌電圖、供應室等醫技檢查科室。
虎門醫院盧屋門診部：設有內、外、婦、兒等門診診室；城區計免門診；社區衛生服務中心；設有檢驗科、放射科、B超、心電圖等醫技檢查科室。
虎門醫院設備：擁有德國西門子·邁迪特1.5T超導磁共振（樹田分院）、GE螺旋CT掃描儀、島津500mA X光機、西門子1000mA數字減影X光機、美國彩色B超、西門子黑白B超、腦電圖、肌電圖誘發電位、動態血壓和動態心電圖、美國經顱多普勒腦血流儀、意大利肺功能檢測儀、全自動生化、血氣分析儀、進口呼吸機、腦室鏡、膽道鏡、胸腔鏡、腹腔鏡、輸尿管鏡、前列腺氣化電切鏡、喉鏡、支氣管鏡、電子胃鏡、腸鏡等一大批高、精、尖設備。擁有電子圖書館，總固定資產逾1億元人民幣。
虎門醫院特色專科：經過50年的艱苦創業，醫院逐步形成了院有重點、科有特色、人有專長、分科精細的現代化醫院新格局。
于1989年就建立了具有快速反應能力的省內首家鎮級創傷急救機構—虎門創傷急救中心（因配合政府城市規劃建設，急救中心于2007年7月與醫院急診科合并搬遷至樹田分院）。
骨外科—科室在骨折微創治療、嚴重骨與關節損傷治療、肢體嚴重創傷修復與重建、骨盆與髖臼骨折治療等已形成明顯的專科特色與技術優勢,并帶動其他骨科疾病診療水平的明顯提高。學科帶頭人、骨科主任醫師、院長歐耀芬是東莞市骨科專業委員會主任委員，在創傷急救處理、肢體嚴重創傷顯微修復與重建、脊柱與骨盆損傷等方面有很高造詣。科室多項成果獲得市科技進步獎。
腦科—是我市最早成立的專科科室之一。科室開展了高血壓腦出血立體定向引流手術;顱內動脈瘤栓塞、腦血管畸形栓塞、頸內動脈支架成形、介入溶栓等神經血管內治療技術；腦腫瘤的立體定向顯微手術及腦積水和蛛網膜囊腫的內窺鏡手術等，形成了以腦外傷急救和腦中風急救為基礎，腦腫瘤、腦血管病等神經系統常見病多發病的內外科治療并重的專科特色。學科帶頭人、神經外科主任醫師、腦科主任黃啟銳曾到美國杜克大學進修學習。科室多項成果獲得市科技進步獎。
手外科—自1991年開展東莞市首例拇指離斷再植手術及1995年成功開展廣東省第一例、全國第七例十指完全離斷再植并獲得“廣東省科技進步二等獎”以來，手外傷的微創技術得到長足發展。目前開展的業務有斷指（趾）再植、拇手指再造、手外傷治療、組織缺損皮瓣治療、手功能重建、手病、腫瘤治療及手功能康復等項目。科室多項成果獲得市科技進步獎。
普外科—科室設有肝、膽、胰專業組；胃、腸專業組；燒傷、痔瘡、乳腺專業組。并設置普外、肛腸病、乳腺病、整形外科專家門診。科室主要開展手術治療有甲狀腺良、惡性腫瘤，乳腺良、惡性腫瘤，食管、肺、胃腸道、肝、膽、胰、腎、膀胱腫瘤；肝癌插管介入化療，各種微創外科手術治療膽囊、膽管結石，腎、輸尿管、膀胱結石，前列腺電切術，大面積燒傷救治。內外痔、肛瘺、肛裂等肛腸外科疾病。學科帶頭人、普外科主任醫師、副院長劉彪是東莞市微創外科專業委員會主任委員，在甲狀腺手術、腹腔鏡手術及腫瘤介入治療方面有非常豐富的臨床經驗。
心內科—科室目前已能開展各種心臟疾病診斷及治療，包括冠心病、心肌梗死、風濕性心臟病、先天性心臟病、心肌炎、心肌病、各種心律失常、急慢性心力衰竭及心臟相關疾病如高血壓病、糖尿病、腎病等；成熟開展冠狀動脈造影術、冠狀動脈腔內成形術、冠狀動脈支架植入術、瓣膜球囊擴張成形術、房室缺封堵術及心臟起搏器植入術等。學科帶頭人、心血管內科副主任醫師袁斌是河南省高血壓專業委員會委員、河南省心電生理與心臟起搏專業委員長會委員，對疑難心血管病的診斷與治療、冠心病的冠狀動脈造影、支架植入治療等有較深造詣。
康復科—是我市最早設立的專科科室之一，設在風景秀麗的虎門醫院樹田分院，風景宜人，......
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